Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ6

JPH4, Junctophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH4Q96JJ6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
JPH4Q96JJ6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
JPH4Q96JJ6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
JPH4Q96JJ6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
JPH4Q96JJ6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
JPH4Q96JJ6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC38.9■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.89■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.89■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
JPH4Q96JJ6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
JPH4Q96JJ6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
JPH4Q96JJ6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
JPH4Q96JJ6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
JPH4Q96JJ6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
JPH4Q96JJ6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
JPH4Q96JJ6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
JPH4Q96JJ6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
JPH4Q96JJ6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
JPH4Q96JJ6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
JPH4Q96JJ6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
JPH4Q96JJ6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
JPH4Q96JJ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
JPH4Q96JJ6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
JPH4Q96JJ6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
JPH4Q96JJ6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
JPH4Q96JJ6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
JPH4Q96JJ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
JPH4Q96JJ6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
JPH4Q96JJ6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
JPH4Q96JJ6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
JPH4Q96JJ6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
JPH4Q96JJ6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
JPH4Q96JJ6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
JPH4Q96JJ6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
JPH4Q96JJ6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
JPH4Q96JJ6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
JPH4Q96JJ6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
JPH4Q96JJ6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
JPH4Q96JJ6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
JPH4Q96JJ6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
JPH4Q96JJ6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
JPH4Q96JJ6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
JPH4Q96JJ6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
JPH4Q96JJ6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
JPH4Q96JJ6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
JPH4Q96JJ6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
JPH4Q96JJ6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
JPH4Q96JJ6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms