Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM3DQ96BQ1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM3DQ96BQ1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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