Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CSRNP3Q8WYN3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CSRNP3Q8WYN3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CSRNP3Q8WYN3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
CSRNP3Q8WYN3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CSRNP3Q8WYN3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CSRNP3Q8WYN3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CSRNP3Q8WYN3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CSRNP3Q8WYN3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CSRNP3Q8WYN3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CSRNP3Q8WYN3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CSRNP3Q8WYN3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
CSRNP3Q8WYN3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CSRNP3Q8WYN3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
CSRNP3Q8WYN3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CSRNP3Q8WYN3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CSRNP3Q8WYN3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CSRNP3Q8WYN3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CSRNP3Q8WYN3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CSRNP3Q8WYN3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CSRNP3Q8WYN3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms