Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC4Q8WW27 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC4Q8WW27 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC4Q8WW27 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms