Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C4orf3Q8WVX3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C4orf3Q8WVX3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms