Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HELQQ8TDG4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HELQQ8TDG4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms