Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
BHLHE23Q8NDY6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE23Q8NDY6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE23Q8NDY6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms