Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMG8Q8ND04 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMG8Q8ND04 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMG8Q8ND04 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
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