Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD53Q8N9V6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ANKRD53Q8N9V6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ANKRD53Q8N9V6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms