Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTL3Q8N8U3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTL3Q8N8U3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms