Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
LTBP4Q8N2S1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
LTBP4Q8N2S1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
LTBP4Q8N2S1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
LTBP4Q8N2S1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
LTBP4Q8N2S1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
LTBP4Q8N2S1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LTBP4Q8N2S1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LTBP4Q8N2S1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LTBP4Q8N2S1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
LTBP4Q8N2S1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LTBP4Q8N2S1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LTBP4Q8N2S1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LTBP4Q8N2S1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LTBP4Q8N2S1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LTBP4Q8N2S1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
LTBP4Q8N2S1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LTBP4Q8N2S1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LTBP4Q8N2S1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LTBP4Q8N2S1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LTBP4Q8N2S1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
LTBP4Q8N2S1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LTBP4Q8N2S1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LTBP4Q8N2S1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LTBP4Q8N2S1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LTBP4Q8N2S1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LTBP4Q8N2S1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LTBP4Q8N2S1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LTBP4Q8N2S1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
LTBP4Q8N2S1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LTBP4Q8N2S1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms