Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1S5

CHST9, Carbohydrate sulfotransferase 9, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST9Q7L1S5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHST9Q7L1S5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms