Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

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Length 78 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CSAG1Q6PB30 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CSAG1Q6PB30 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CSAG1Q6PB30 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CSAG1Q6PB30 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CSAG1Q6PB30 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CSAG1Q6PB30 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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