Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAVIN1Q6NZI2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CAVIN1Q6NZI2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAVIN1Q6NZI2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms