Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TYW3Q6IPR3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TYW3Q6IPR3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TYW3Q6IPR3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TYW3Q6IPR3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TYW3Q6IPR3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TYW3Q6IPR3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TYW3Q6IPR3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TYW3Q6IPR3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TYW3Q6IPR3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TYW3Q6IPR3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TYW3Q6IPR3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TYW3Q6IPR3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TYW3Q6IPR3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TYW3Q6IPR3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TYW3Q6IPR3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TYW3Q6IPR3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TYW3Q6IPR3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TYW3Q6IPR3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TYW3Q6IPR3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TYW3Q6IPR3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms