Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP9Q5VTM2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms