Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CC2D1BQ5T0F9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CC2D1BQ5T0F9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CC2D1BQ5T0F9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms