Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NOM1Q5C9Z4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NOM1Q5C9Z4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NOM1Q5C9Z4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NOM1Q5C9Z4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms