Protein–RNA interactions for Protein: Q53TQ3

INO80D, INO80 complex subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80DQ53TQ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INO80DQ53TQ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INO80DQ53TQ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms