Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTU2Q2VPK5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTU2Q2VPK5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms