Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC85BQ15834 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC85BQ15834 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC85BQ15834 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms