Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKD1Q15139 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKD1Q15139 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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