Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDC1Q14676 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MDC1Q14676 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MDC1Q14676 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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