Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLF9Q13886 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF9Q13886 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF9Q13886 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms