Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL3Q13618 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CUL3Q13618 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL3Q13618 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
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