Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 YDL124WYDL124W 939 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 YPI1YFR003C 468 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 SDS3YIL084C 984 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 MBR1YKL093W 1020 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 EBP2YKL172W 1284 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 MIA40YKL195W 1212 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 ROX3YBL093C 663 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 RFC4YOL094C 972 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 MED4YOR174W 855 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 YBR063CYBR063C 1215 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 AOS1YPR180W 1044 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 PWR1PWR1 941 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 MDM31YHR194W 1740 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 ALG1YBR110W 1350 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 DXO1YDR370C 1329 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 GDA1YEL042W 1557 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 HOS1YPR068C 1413 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 YDL027CYDL027C 1263 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 BTN2YGR142W 1233 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 YGR273CYGR273C 525 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 SPO7YAL009W 780 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 PSF2YJL072C 642 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 ADO1YJR105W 1023 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 PDR16YNL231C 1056 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 FDH1YOR388C 1131 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 SPO19YPL130W 672 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 YLR173WYLR173W 1827 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 AQR1YNL065W 1761 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 SGF73YGL066W 1974 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 CTF13YMR094W 1437 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 LYS20YDL182W 1287 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 CIR1YGR207C 786 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 PRE3YJL001W 648 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 AIM25YJR100C 984 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 YLR280CYLR280C 351 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 YOR152CYOR152C 771 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 YPR109WYPR109W 885 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 RRT2YBR246W 1164 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 SAM50YNL026W 1455 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 NDE2YDL085W 1638 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 RRP43YCR035C 1185 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 ARO3YDR035W 1113 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 YDR278CYDR278C 318 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 IPI1YHR085W 1005 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 DLT1YMR126C 1029 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 EAF7YNL136W 1278 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 YOL035CYOL035C 303 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 MRN1YPL184C 1839 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-DR3Q12441 TUB4YLR212C 1422 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 BMH1YER177W 804 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 YGL034CYGL034C 366 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 YGR012WYGR012W 1182 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 YHB1YGR234W 1200 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 CUP1-1YHR053C 186 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 CUP1-2YHR055C 186 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 SPC34YKR037C 888 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 SAS5YOR213C 747 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 MGE1YOR232W 687 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 YBR053CYBR053C 1077 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 CDC13YDL220C 2775 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 snR63snR63 255 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 AIR2YDL175C 1035 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 ADE8YDR408C 645 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 COBQ0105 1158 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 PRP38YGR075C 729 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 YJL055WYJL055W 738 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 MHT1YLL062C 975 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 SMD2YLR275W 333 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 snR31snR31 225 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 SAN1YDR143C 1833 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 MCH1YDL054C 1461 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 DFG5YMR238W 1377 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 MSS2YDL107W 1056 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 CPR1YDR155C 489 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 SPT3YDR392W 1014 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 RPT3YDR394W 1287 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 PAD1YDR538W 729 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 HGH1YGR187C 1185 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 COS8YHL048W 1146 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 PRP21YJL203W 843 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 YJL215CYJL215C 360 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 DID4YKL002W 699 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 YAR069CYAR069C 294 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 SPR3YGR059W 1539 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 YHL012WYHL012W 1482 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 LAG2YOL025W 1983 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 KEG1YFR042W 603 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 PTI1YGR156W 1278 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 SRP21YKL122C 504 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 CMC1YKL137W 336 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 YML119WYML119W 1074 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 SPS4YOR313C 1017 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 CSH1YBR161W 1131 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 POB3YML069W 1659 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 PMT3YOR321W 2262 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 TGL2YDR058C 981 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-DR3Q12441 YFR020WYFR020W 699 nt6.98□□□□□ -1.29
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