Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTDSPL2Q05D32 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTDSPL2Q05D32 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CTDSPL2Q05D32 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms