Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNP2Q05952 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNP2Q05952 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNP2Q05952 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms