Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 PYK2YOR347C 1521 nt7.05□□□□□ -1.28
HRQ1Q05549 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt7.04□□□□□ -1.28
HRQ1Q05549 YKR075CYKR075C 924 nt7.04□□□□□ -1.28
HRQ1Q05549 WHI2YOR043W 1461 nt7.04□□□□□ -1.28
HRQ1Q05549 RVB2YPL235W 1416 nt7.03□□□□□ -1.28
HRQ1Q05549 POX1YGL205W 2247 nt7.03□□□□□ -1.28
HRQ1Q05549 CSC1YLR241W 2349 nt7.03□□□□□ -1.28
HRQ1Q05549 MAF1YDR005C 1188 nt7.03□□□□□ -1.28
HRQ1Q05549 RPT3YDR394W 1287 nt7.03□□□□□ -1.28
HRQ1Q05549 RRP46YGR095C 672 nt7.03□□□□□ -1.28
HRQ1Q05549 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt7.03□□□□□ -1.28
HRQ1Q05549 TPK1YJL164C 1194 nt7.03□□□□□ -1.28
HRQ1Q05549 YOL163WYOL163W 510 nt7.03□□□□□ -1.28
HRQ1Q05549 POS5YPL188W 1245 nt7.03□□□□□ -1.28
HRQ1Q05549 MNN5YJL186W 1761 nt7.03□□□□□ -1.28
HRQ1Q05549 CMK2YOL016C 1344 nt7.02□□□□□ -1.28
HRQ1Q05549 MED2YDL005C 1296 nt7.02□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 RTN1YDR233C 888 nt7.02□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 SPO12YHR152W 522 nt7.02□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 VPS24YKL041W 675 nt7.02□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 NMD4YLR363C 657 nt7.02□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt7.02□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 AME1YBR211C 975 nt7.02□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 YPL245WYPL245W 1365 nt7.02□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 YCR061WYCR061W 1896 nt7.02□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 GLE1YDL207W 1617 nt7.01□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 NHA1YLR138W 2958 nt7.01□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 KKQ8YKL168C 2175 nt7.01□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt7.01□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt7.01□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt7.01□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt7.01□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt7.01□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 YKL153WYKL153W 510 nt7.01□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 AAT2YLR027C 1257 nt7.01□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 HST3YOR025W 1344 nt7.01□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 VPS4YPR173C 1314 nt7.01□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 TOS2YGR221C 1869 nt7□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 VPS5YOR069W 2028 nt7□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 HER2YMR293C 1395 nt7□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 OAC1YKL120W 975 nt7□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 PEX22YAL055W 543 nt7□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 PSR2YLR019W 1194 nt7□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 UBC12YLR306W 567 nt7□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 VMA4YOR332W 702 nt7□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 OSW2YLR054C 2175 nt7□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 GDA1YEL042W 1557 nt6.99□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 snR57snR57 88 nt6.99□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 CDC34YDR054C 888 nt6.99□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 AIM20YIL158W 615 nt6.99□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 MRS1YIR021W 1092 nt6.99□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 ADD66YKL206C 804 nt6.99□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 SSK22YCR073C 3996 nt6.99□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 MDM31YHR194W 1740 nt6.98□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 CDC1YDR182W 1476 nt6.98□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 RKM4YDR257C 1485 nt6.98□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 CBT1YKL208W 816 nt6.98□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 MCM3YEL032W 2916 nt6.98□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 BCY1YIL033C 1251 nt6.97□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 RPE1YJL121C 717 nt6.97□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 PAP1YKR002W 1707 nt6.97□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 SCS22YBL091C-A 528 nt6.97□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 YOR111WYOR111W 699 nt6.97□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 RPN5YDL147W 1338 nt6.97□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 CLD1YGR110W 1338 nt6.97□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 FRS2YFL022C 1512 nt6.96□□□□□ -1.29
HRQ1Q05549 CRF1YDR223W 1404 nt6.96□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 YIR043CYIR043C 693 nt6.96□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 OMA1YKR087C 1038 nt6.96□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 TSA1YML028W 591 nt6.96□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 RFA2YNL312W 822 nt6.96□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 DRS1YLL008W 2259 nt6.96□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 PAT1YCR077C 2391 nt6.95□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 YET3YDL072C 612 nt6.95□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 RAM1YDL090C 1296 nt6.95□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 RPN11YFR004W 921 nt6.95□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 YGR066CYGR066C 879 nt6.95□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 VTA1YLR181C 993 nt6.95□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 TSR3YOR006C 942 nt6.95□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 HEL1YKR017C 1656 nt6.95□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 YIL055CYIL055C 1884 nt6.95□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 CNM67YNL225C 1746 nt6.95□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 GFA1YKL104C 2154 nt6.95□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 SMC5YOL034W 3282 nt6.95□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 YFL042CYFL042C 2025 nt6.94□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 GYP8YFL027C 1494 nt6.94□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 PHB1YGR132C 864 nt6.94□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 PPA2YMR267W 933 nt6.94□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 MRPS12YNR036C 462 nt6.94□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 RRP40YOL142W 723 nt6.94□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 HEM15YOR176W 1182 nt6.94□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 ECM2YBR065C 1095 nt6.94□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 YPR114WYPR114W 948 nt6.94□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 AFG1YEL052W 1530 nt6.94□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 HXT2YMR011W 1626 nt6.94□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 ESC8YOL017W 2145 nt6.94□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 MAK31YCR020C-A 267 nt6.93□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 COX3Q0275 810 nt6.93□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 HST2YPL015C 1074 nt6.93□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 TIP41YPR040W 1071 nt6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.3 ms