Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 CDC10YCR002C 969 nt5.9□□□□□ -1.46
CIK1Q01649 PEX7YDR142C 1128 nt5.9□□□□□ -1.46
CIK1Q01649 ERP5YHR110W 639 nt5.9□□□□□ -1.46
CIK1Q01649 NPA3YJR072C 1158 nt5.9□□□□□ -1.46
CIK1Q01649 YLL056CYLL056C 897 nt5.9□□□□□ -1.46
CIK1Q01649 LDB7YBL006C 543 nt5.9□□□□□ -1.46
CIK1Q01649 MRPL19YNL185C 477 nt5.9□□□□□ -1.46
CIK1Q01649 FIT2YOR382W 462 nt5.9□□□□□ -1.46
CIK1Q01649 CRZ1YNL027W 2037 nt5.9□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 YJL163CYJL163C 1668 nt5.9□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 DOT1YDR440W 1749 nt5.9□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 ROG3YFR022W 2202 nt5.9□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 CNE1YAL058W 1509 nt5.89□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 GSY2YLR258W 2118 nt5.89□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 NSI1YDR026C 1713 nt5.89□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 LCB3YJL134W 1230 nt5.89□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 SRY1YKL218C 981 nt5.89□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 DID2YKR035W-A 615 nt5.89□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 YOL046CYOL046C 675 nt5.89□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 KTR1YOR099W 1182 nt5.89□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 SCO2YBR024W 906 nt5.89□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 RPL21AYBR191W 483 nt5.89□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 GEX1YCL073C 1848 nt5.89□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.88□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 LDB16YCL005W 771 nt5.88□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 TEP1YNL128W 1305 nt5.88□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 RCK1YGL158W 1539 nt5.88□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 MSC3YLR219W 2187 nt5.87□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 FAL1YDR021W 1200 nt5.87□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 YOL163WYOL163W 510 nt5.87□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 YPR076WYPR076W 375 nt5.87□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 MET7YOR241W 1647 nt5.87□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 FOB1YDR110W 1701 nt5.87□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 MNN5YJL186W 1761 nt5.87□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 GUP2YPL189W 1830 nt5.87□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 RIM101YHL027W 1878 nt5.87□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 YGR054WYGR054W 1929 nt5.86□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 COX15YER141W 1461 nt5.86□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 PMP3YDR276C 168 nt5.86□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 MDE1YJR024C 735 nt5.86□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 VMA4YOR332W 702 nt5.86□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 CWC27YPL064C 906 nt5.86□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.85□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 CST6YIL036W 1764 nt5.85□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 URA7YBL039C 1740 nt5.85□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 TRP3YKL211C 1455 nt5.85□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 YLH47YPR125W 1365 nt5.85□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 KRE9YJL174W 831 nt5.85□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 SSK1YLR006C 2139 nt5.85□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 POR1YNL055C 852 nt5.85□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 NPT1YOR209C 1290 nt5.85□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 GLN1YPR035W 1113 nt5.85□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 CCZ1YBR131W 2115 nt5.85□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 AAP1YHR047C 2571 nt5.84□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 YJL171CYJL171C 1191 nt5.84□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 TEL2YGR099W 2067 nt5.84□□□□□ -1.47
CIK1Q01649 NUP49YGL172W 1419 nt5.83□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 ALT1YLR089C 1779 nt5.83□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 PPH21YDL134C 1110 nt5.83□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 YIR042CYIR042C 711 nt5.83□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 POP5YAL033W 522 nt5.83□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 YNL228WYNL228W 777 nt5.83□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 IFA38YBR159W 1044 nt5.83□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 PTR2YKR093W 1806 nt5.83□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 PPR1YLR014C 2715 nt5.83□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 TBF1YPL128C 1689 nt5.82□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 NOP2YNL061W 1857 nt5.82□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 POR2YIL114C 846 nt5.82□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 RPE1YJL121C 717 nt5.82□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 HOC1YJR075W 1191 nt5.82□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 YHK8YHR048W 1545 nt5.82□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 MCH1YDL054C 1461 nt5.82□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 PRP40YKL012W 1752 nt5.81□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 SPC97YHR172W 2472 nt5.81□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 CHO1YER026C 831 nt5.81□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 COS6YGR295C 1146 nt5.81□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 RUF23RUF23 254 nt5.81□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 YNL194CYNL194C 906 nt5.81□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 OXP1YKL215C 3861 nt5.81□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 NUP1YOR098C 3231 nt5.8□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 IPK1YDR315C 846 nt5.8□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 YGL235WYGL235W 537 nt5.8□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 MEH1YKR007W 555 nt5.8□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 RNR3YIL066C 2610 nt5.79□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 TIM22YDL217C 624 nt5.79□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 VMA3YEL027W 483 nt5.79□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.79□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 LYS1YIR034C 1122 nt5.79□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 YJL193WYJL193W 1209 nt5.79□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 LIA1YJR070C 978 nt5.79□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 YOL131WYOL131W 327 nt5.79□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 ELC1YPL046C 300 nt5.79□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 ECM31YBR176W 939 nt5.79□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 MAL11YGR289C 1851 nt5.79□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 VTC2YFL004W 2487 nt5.79□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 HIR1YBL008W 2523 nt5.78□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 SSK22YCR073C 3996 nt5.78□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 EAF5YEL018W 840 nt5.78□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 VAM7YGL212W 951 nt5.78□□□□□ -1.48
CIK1Q01649 YHR095WYHR095W 495 nt5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.9 ms