Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBXN2AP68543 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBXN2AP68543 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBXN2AP68543 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms