Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK2A1P68400 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK2A1P68400 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK2A1P68400 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms