Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GNB1P62873 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GNB1P62873 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GNB1P62873 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GNB1P62873 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GNB1P62873 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GNB1P62873 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GNB1P62873 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GNB1P62873 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GNB1P62873 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB1P62873 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB1P62873 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB1P62873 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB1P62873 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB1P62873 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB1P62873 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB1P62873 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB1P62873 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GNB1P62873 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GNB1P62873 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GNB1P62873 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GNB1P62873 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GNB1P62873 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GNB1P62873 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GNB1P62873 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GNB1P62873 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GNB1P62873 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB1P62873 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB1P62873 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB1P62873 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB1P62873 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB1P62873 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB1P62873 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB1P62873 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB1P62873 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB1P62873 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB1P62873 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB1P62873 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GNB1P62873 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB1P62873 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB1P62873 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB1P62873 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB1P62873 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB1P62873 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB1P62873 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GNB1P62873 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB1P62873 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB1P62873 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB1P62873 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB1P62873 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB1P62873 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB1P62873 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB1P62873 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB1P62873 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GNB1P62873 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GNB1P62873 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GNB1P62873 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GNB1P62873 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GNB1P62873 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GNB1P62873 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GNB1P62873 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GNB1P62873 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GNB1P62873 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GNB1P62873 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GNB1P62873 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GNB1P62873 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GNB1P62873 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GNB1P62873 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB1P62873 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB1P62873 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB1P62873 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB1P62873 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB1P62873 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB1P62873 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB1P62873 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB1P62873 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB1P62873 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB1P62873 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB1P62873 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB1P62873 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GNB1P62873 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB1P62873 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB1P62873 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB1P62873 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB1P62873 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB1P62873 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB1P62873 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB1P62873 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB1P62873 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB1P62873 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GNB1P62873 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB1P62873 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB1P62873 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB1P62873 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB1P62873 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB1P62873 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB1P62873 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB1P62873 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB1P62873 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GNB1P62873 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms