Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23P62829 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23P62829 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL23P62829 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23P62829 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23P62829 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23P62829 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23P62829 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23P62829 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23P62829 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23P62829 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23P62829 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23P62829 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPL23P62829 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL23P62829 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL23P62829 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL23P62829 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL23P62829 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL23P62829 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL23P62829 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL23P62829 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL23P62829 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL23P62829 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL23P62829 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL23P62829 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23P62829 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23P62829 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23P62829 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23P62829 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23P62829 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23P62829 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23P62829 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23P62829 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23P62829 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23P62829 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23P62829 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23P62829 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23P62829 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23P62829 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23P62829 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23P62829 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23P62829 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23P62829 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23P62829 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23P62829 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23P62829 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23P62829 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23P62829 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23P62829 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23P62829 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23P62829 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL23P62829 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL23P62829 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL23P62829 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL23P62829 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL23P62829 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL23P62829 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL23P62829 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL23P62829 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL23P62829 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL23P62829 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL23P62829 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL23P62829 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL23P62829 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL23P62829 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL23P62829 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL23P62829 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL23P62829 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL23P62829 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL23P62829 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL23P62829 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL23P62829 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL23P62829 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23P62829 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23P62829 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23P62829 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23P62829 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23P62829 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23P62829 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23P62829 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23P62829 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23P62829 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23P62829 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23P62829 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23P62829 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL23P62829 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL23P62829 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL23P62829 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL23P62829 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL23P62829 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL23P62829 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL23P62829 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23P62829 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23P62829 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23P62829 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23P62829 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23P62829 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23P62829 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23P62829 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23P62829 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms