Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB5CP51148 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB5CP51148 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB5CP51148 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 366.5 ms