Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPT1P50897 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPT1P50897 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPT1P50897 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPT1P50897 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPT1P50897 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPT1P50897 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPT1P50897 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PPT1P50897 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPT1P50897 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPT1P50897 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPT1P50897 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPT1P50897 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPT1P50897 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPT1P50897 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPT1P50897 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PPT1P50897 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPT1P50897 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PPT1P50897 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPT1P50897 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPT1P50897 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPT1P50897 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPT1P50897 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPT1P50897 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPT1P50897 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PPT1P50897 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPT1P50897 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PPT1P50897 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPT1P50897 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPT1P50897 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPT1P50897 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPT1P50897 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPT1P50897 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPT1P50897 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPT1P50897 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPT1P50897 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPT1P50897 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPT1P50897 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PPT1P50897 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPT1P50897 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPT1P50897 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPT1P50897 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPT1P50897 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPT1P50897 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPT1P50897 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPT1P50897 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPT1P50897 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PPT1P50897 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPT1P50897 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPT1P50897 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPT1P50897 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPT1P50897 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPT1P50897 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPT1P50897 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPT1P50897 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPT1P50897 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPT1P50897 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPT1P50897 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPT1P50897 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPT1P50897 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPT1P50897 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPT1P50897 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPT1P50897 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPT1P50897 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPT1P50897 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPT1P50897 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPT1P50897 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPT1P50897 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPT1P50897 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPT1P50897 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPT1P50897 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPT1P50897 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPT1P50897 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPT1P50897 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPT1P50897 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PPT1P50897 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPT1P50897 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPT1P50897 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPT1P50897 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPT1P50897 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPT1P50897 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPT1P50897 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPT1P50897 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPT1P50897 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPT1P50897 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPT1P50897 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPT1P50897 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPT1P50897 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPT1P50897 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPT1P50897 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPT1P50897 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PPT1P50897 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPT1P50897 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPT1P50897 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPT1P50897 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPT1P50897 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPT1P50897 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPT1P50897 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPT1P50897 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPT1P50897 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms