Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPINT3P49223 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPINT3P49223 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINT3P49223 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINT3P49223 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINT3P49223 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINT3P49223 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINT3P49223 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINT3P49223 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINT3P49223 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPINT3P49223 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPINT3P49223 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SPINT3P49223 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPINT3P49223 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPINT3P49223 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINT3P49223 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPINT3P49223 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms