Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPARGP37231 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGP37231 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGP37231 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGP37231 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGP37231 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGP37231 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGP37231 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGP37231 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGP37231 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPARGP37231 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARGP37231 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARGP37231 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARGP37231 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARGP37231 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARGP37231 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARGP37231 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARGP37231 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARGP37231 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPARGP37231 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPARGP37231 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPARGP37231 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPARGP37231 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPARGP37231 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPARGP37231 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPARGP37231 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPARGP37231 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPARGP37231 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPARGP37231 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARGP37231 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARGP37231 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARGP37231 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARGP37231 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARGP37231 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPARGP37231 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARGP37231 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARGP37231 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARGP37231 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARGP37231 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARGP37231 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARGP37231 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARGP37231 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARGP37231 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARGP37231 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARGP37231 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARGP37231 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARGP37231 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPARGP37231 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPARGP37231 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPARGP37231 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPARGP37231 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPARGP37231 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPARGP37231 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARGP37231 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARGP37231 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARGP37231 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARGP37231 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARGP37231 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PPARGP37231 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPARGP37231 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPARGP37231 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPARGP37231 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPARGP37231 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPARGP37231 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPARGP37231 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PPARGP37231 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPARGP37231 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPARGP37231 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPARGP37231 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PPARGP37231 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPARGP37231 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPARGP37231 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPARGP37231 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPARGP37231 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPARGP37231 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPARGP37231 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPARGP37231 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPARGP37231 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPARGP37231 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPARGP37231 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPARGP37231 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPARGP37231 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPARGP37231 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPARGP37231 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPARGP37231 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPARGP37231 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPARGP37231 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPARGP37231 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPARGP37231 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PPARGP37231 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPARGP37231 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPARGP37231 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PPARGP37231 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPARGP37231 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPARGP37231 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPARGP37231 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPARGP37231 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPARGP37231 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPARGP37231 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPARGP37231 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms