Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP6V1E1P36543 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6V1E1P36543 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms