Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLD1P28340 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLD1P28340 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLD1P28340 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
POLD1P28340 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLD1P28340 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLD1P28340 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLD1P28340 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLD1P28340 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLD1P28340 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLD1P28340 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLD1P28340 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLD1P28340 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
POLD1P28340 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
POLD1P28340 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
POLD1P28340 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLD1P28340 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLD1P28340 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
POLD1P28340 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLD1P28340 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLD1P28340 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLD1P28340 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLD1P28340 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLD1P28340 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLD1P28340 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLD1P28340 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLD1P28340 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLD1P28340 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLD1P28340 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLD1P28340 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLD1P28340 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLD1P28340 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLD1P28340 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLD1P28340 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLD1P28340 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
POLD1P28340 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLD1P28340 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLD1P28340 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLD1P28340 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLD1P28340 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLD1P28340 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLD1P28340 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLD1P28340 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLD1P28340 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLD1P28340 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLD1P28340 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLD1P28340 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLD1P28340 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLD1P28340 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLD1P28340 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLD1P28340 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLD1P28340 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLD1P28340 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLD1P28340 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLD1P28340 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLD1P28340 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
POLD1P28340 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLD1P28340 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLD1P28340 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLD1P28340 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLD1P28340 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLD1P28340 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
POLD1P28340 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLD1P28340 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLD1P28340 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLD1P28340 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
POLD1P28340 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLD1P28340 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
POLD1P28340 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
POLD1P28340 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
POLD1P28340 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLD1P28340 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLD1P28340 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
POLD1P28340 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
POLD1P28340 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLD1P28340 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLD1P28340 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLD1P28340 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLD1P28340 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLD1P28340 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
POLD1P28340 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLD1P28340 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLD1P28340 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
POLD1P28340 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLD1P28340 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLD1P28340 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLD1P28340 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLD1P28340 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLD1P28340 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLD1P28340 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLD1P28340 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLD1P28340 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
POLD1P28340 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLD1P28340 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
POLD1P28340 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
POLD1P28340 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLD1P28340 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLD1P28340 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLD1P28340 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
POLD1P28340 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms