Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GADD45AP24522 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GADD45AP24522 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GADD45AP24522 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GADD45AP24522 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GADD45AP24522 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45AP24522 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45AP24522 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45AP24522 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45AP24522 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45AP24522 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45AP24522 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45AP24522 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45AP24522 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45AP24522 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GADD45AP24522 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45AP24522 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45AP24522 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45AP24522 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45AP24522 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45AP24522 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GADD45AP24522 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GADD45AP24522 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GADD45AP24522 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GADD45AP24522 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GADD45AP24522 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GADD45AP24522 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GADD45AP24522 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GADD45AP24522 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GADD45AP24522 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GADD45AP24522 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GADD45AP24522 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GADD45AP24522 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GADD45AP24522 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GADD45AP24522 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GADD45AP24522 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GADD45AP24522 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GADD45AP24522 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GADD45AP24522 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GADD45AP24522 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GADD45AP24522 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GADD45AP24522 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GADD45AP24522 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GADD45AP24522 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GADD45AP24522 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GADD45AP24522 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GADD45AP24522 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GADD45AP24522 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GADD45AP24522 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GADD45AP24522 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GADD45AP24522 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GADD45AP24522 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GADD45AP24522 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GADD45AP24522 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GADD45AP24522 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GADD45AP24522 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GADD45AP24522 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GADD45AP24522 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GADD45AP24522 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GADD45AP24522 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GADD45AP24522 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GADD45AP24522 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GADD45AP24522 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GADD45AP24522 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GADD45AP24522 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms