Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCSHP23434 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCSHP23434 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCSHP23434 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCSHP23434 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCSHP23434 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCSHP23434 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCSHP23434 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCSHP23434 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCSHP23434 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCSHP23434 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCSHP23434 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCSHP23434 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCSHP23434 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCSHP23434 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCSHP23434 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCSHP23434 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCSHP23434 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCSHP23434 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCSHP23434 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCSHP23434 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCSHP23434 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCSHP23434 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCSHP23434 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCSHP23434 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCSHP23434 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCSHP23434 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCSHP23434 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCSHP23434 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCSHP23434 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCSHP23434 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCSHP23434 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCSHP23434 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCSHP23434 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCSHP23434 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCSHP23434 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCSHP23434 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCSHP23434 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCSHP23434 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GCSHP23434 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCSHP23434 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCSHP23434 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCSHP23434 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCSHP23434 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCSHP23434 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCSHP23434 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCSHP23434 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GCSHP23434 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCSHP23434 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCSHP23434 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCSHP23434 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GCSHP23434 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCSHP23434 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCSHP23434 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCSHP23434 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCSHP23434 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCSHP23434 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCSHP23434 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCSHP23434 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCSHP23434 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCSHP23434 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GCSHP23434 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCSHP23434 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCSHP23434 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCSHP23434 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCSHP23434 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCSHP23434 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GCSHP23434 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCSHP23434 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCSHP23434 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCSHP23434 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCSHP23434 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCSHP23434 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCSHP23434 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCSHP23434 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCSHP23434 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCSHP23434 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCSHP23434 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCSHP23434 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCSHP23434 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCSHP23434 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCSHP23434 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCSHP23434 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCSHP23434 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCSHP23434 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCSHP23434 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCSHP23434 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCSHP23434 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCSHP23434 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCSHP23434 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GCSHP23434 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCSHP23434 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCSHP23434 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCSHP23434 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCSHP23434 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCSHP23434 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCSHP23434 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCSHP23434 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCSHP23434 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCSHP23434 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms