Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX1P22670 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX1P22670 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX1P22670 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX1P22670 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RFX1P22670 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RFX1P22670 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RFX1P22670 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFX1P22670 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFX1P22670 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFX1P22670 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFX1P22670 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFX1P22670 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX1P22670 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX1P22670 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX1P22670 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX1P22670 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX1P22670 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX1P22670 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX1P22670 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX1P22670 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX1P22670 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX1P22670 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX1P22670 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFX1P22670 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFX1P22670 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFX1P22670 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFX1P22670 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFX1P22670 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX1P22670 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX1P22670 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX1P22670 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX1P22670 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX1P22670 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX1P22670 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX1P22670 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX1P22670 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX1P22670 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX1P22670 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX1P22670 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX1P22670 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX1P22670 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX1P22670 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX1P22670 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX1P22670 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX1P22670 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFX1P22670 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFX1P22670 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFX1P22670 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFX1P22670 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFX1P22670 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFX1P22670 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFX1P22670 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX1P22670 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX1P22670 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX1P22670 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX1P22670 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX1P22670 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX1P22670 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX1P22670 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX1P22670 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFX1P22670 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFX1P22670 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFX1P22670 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFX1P22670 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFX1P22670 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFX1P22670 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RFX1P22670 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX1P22670 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX1P22670 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX1P22670 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX1P22670 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX1P22670 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX1P22670 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX1P22670 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX1P22670 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX1P22670 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFX1P22670 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX1P22670 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX1P22670 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX1P22670 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX1P22670 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX1P22670 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX1P22670 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX1P22670 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX1P22670 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX1P22670 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX1P22670 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFX1P22670 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX1P22670 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX1P22670 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX1P22670 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX1P22670 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX1P22670 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX1P22670 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX1P22670 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX1P22670 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFX1P22670 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RFX1P22670 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX1P22670 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms