Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRM3P20309 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRM3P20309 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRM3P20309 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms