Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RXRAP19793 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RXRAP19793 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RXRAP19793 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RXRAP19793 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RXRAP19793 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RXRAP19793 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RXRAP19793 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RXRAP19793 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RXRAP19793 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RXRAP19793 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RXRAP19793 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RXRAP19793 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RXRAP19793 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RXRAP19793 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RXRAP19793 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RXRAP19793 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RXRAP19793 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RXRAP19793 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RXRAP19793 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RXRAP19793 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RXRAP19793 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RXRAP19793 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RXRAP19793 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RXRAP19793 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RXRAP19793 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RXRAP19793 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RXRAP19793 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RXRAP19793 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RXRAP19793 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RXRAP19793 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RXRAP19793 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RXRAP19793 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RXRAP19793 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RXRAP19793 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RXRAP19793 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RXRAP19793 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RXRAP19793 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RXRAP19793 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RXRAP19793 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RXRAP19793 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RXRAP19793 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RXRAP19793 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RXRAP19793 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RXRAP19793 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RXRAP19793 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RXRAP19793 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RXRAP19793 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RXRAP19793 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RXRAP19793 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RXRAP19793 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RXRAP19793 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RXRAP19793 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RXRAP19793 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RXRAP19793 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RXRAP19793 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RXRAP19793 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RXRAP19793 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RXRAP19793 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
RXRAP19793 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RXRAP19793 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RXRAP19793 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RXRAP19793 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RXRAP19793 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RXRAP19793 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RXRAP19793 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RXRAP19793 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RXRAP19793 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RXRAP19793 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RXRAP19793 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RXRAP19793 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RXRAP19793 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RXRAP19793 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RXRAP19793 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RXRAP19793 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RXRAP19793 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RXRAP19793 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRAP19793 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRAP19793 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRAP19793 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRAP19793 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRAP19793 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRAP19793 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RXRAP19793 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRAP19793 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRAP19793 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRAP19793 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRAP19793 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRAP19793 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RXRAP19793 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRAP19793 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRAP19793 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRAP19793 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRAP19793 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRAP19793 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRAP19793 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRAP19793 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRAP19793 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRAP19793 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RXRAP19793 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms