Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BMP3P12645 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BMP3P12645 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BMP3P12645 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BMP3P12645 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BMP3P12645 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BMP3P12645 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BMP3P12645 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BMP3P12645 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BMP3P12645 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BMP3P12645 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BMP3P12645 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BMP3P12645 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BMP3P12645 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BMP3P12645 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BMP3P12645 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BMP3P12645 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BMP3P12645 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BMP3P12645 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BMP3P12645 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BMP3P12645 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BMP3P12645 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BMP3P12645 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BMP3P12645 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BMP3P12645 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BMP3P12645 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BMP3P12645 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BMP3P12645 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BMP3P12645 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BMP3P12645 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BMP3P12645 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BMP3P12645 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
BMP3P12645 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BMP3P12645 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BMP3P12645 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BMP3P12645 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BMP3P12645 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BMP3P12645 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BMP3P12645 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BMP3P12645 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BMP3P12645 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BMP3P12645 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BMP3P12645 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BMP3P12645 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BMP3P12645 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BMP3P12645 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BMP3P12645 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BMP3P12645 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BMP3P12645 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BMP3P12645 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BMP3P12645 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BMP3P12645 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BMP3P12645 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BMP3P12645 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BMP3P12645 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BMP3P12645 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BMP3P12645 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BMP3P12645 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BMP3P12645 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BMP3P12645 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BMP3P12645 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BMP3P12645 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BMP3P12645 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BMP3P12645 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BMP3P12645 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BMP3P12645 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BMP3P12645 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BMP3P12645 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BMP3P12645 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
BMP3P12645 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BMP3P12645 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
BMP3P12645 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BMP3P12645 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BMP3P12645 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BMP3P12645 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BMP3P12645 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BMP3P12645 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BMP3P12645 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BMP3P12645 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BMP3P12645 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BMP3P12645 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BMP3P12645 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BMP3P12645 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BMP3P12645 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BMP3P12645 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BMP3P12645 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BMP3P12645 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BMP3P12645 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BMP3P12645 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BMP3P12645 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BMP3P12645 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BMP3P12645 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BMP3P12645 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BMP3P12645 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BMP3P12645 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BMP3P12645 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BMP3P12645 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
BMP3P12645 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BMP3P12645 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BMP3P12645 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms