Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FCER1AP12319 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FCER1AP12319 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
FCER1AP12319 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FCER1AP12319 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FCER1AP12319 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FCER1AP12319 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FCER1AP12319 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FCER1AP12319 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FCER1AP12319 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FCER1AP12319 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FCER1AP12319 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FCER1AP12319 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FCER1AP12319 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FCER1AP12319 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FCER1AP12319 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FCER1AP12319 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FCER1AP12319 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FCER1AP12319 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FCER1AP12319 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FCER1AP12319 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FCER1AP12319 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FCER1AP12319 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FCER1AP12319 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FCER1AP12319 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FCER1AP12319 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FCER1AP12319 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FCER1AP12319 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FCER1AP12319 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FCER1AP12319 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms