Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF888P0CJ79 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF888P0CJ79 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms