Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRNPP04156 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRNPP04156 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRNPP04156 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRNPP04156 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRNPP04156 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRNPP04156 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRNPP04156 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRNPP04156 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRNPP04156 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRNPP04156 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRNPP04156 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRNPP04156 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRNPP04156 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRNPP04156 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRNPP04156 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRNPP04156 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRNPP04156 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRNPP04156 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRNPP04156 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRNPP04156 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRNPP04156 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRNPP04156 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRNPP04156 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRNPP04156 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRNPP04156 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRNPP04156 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRNPP04156 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRNPP04156 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRNPP04156 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRNPP04156 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRNPP04156 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRNPP04156 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRNPP04156 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRNPP04156 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRNPP04156 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRNPP04156 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRNPP04156 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRNPP04156 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRNPP04156 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRNPP04156 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRNPP04156 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRNPP04156 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRNPP04156 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRNPP04156 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRNPP04156 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRNPP04156 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRNPP04156 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRNPP04156 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRNPP04156 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRNPP04156 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRNPP04156 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRNPP04156 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRNPP04156 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRNPP04156 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRNPP04156 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRNPP04156 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRNPP04156 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRNPP04156 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRNPP04156 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRNPP04156 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRNPP04156 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PRNPP04156 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRNPP04156 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRNPP04156 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRNPP04156 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRNPP04156 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRNPP04156 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRNPP04156 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRNPP04156 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRNPP04156 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRNPP04156 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRNPP04156 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRNPP04156 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRNPP04156 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRNPP04156 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRNPP04156 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRNPP04156 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRNPP04156 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRNPP04156 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRNPP04156 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRNPP04156 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRNPP04156 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRNPP04156 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRNPP04156 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRNPP04156 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRNPP04156 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRNPP04156 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRNPP04156 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRNPP04156 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRNPP04156 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRNPP04156 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRNPP04156 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRNPP04156 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRNPP04156 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRNPP04156 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRNPP04156 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRNPP04156 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRNPP04156 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRNPP04156 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms