Protein–RNA interactions for Protein: P02745

C1QA, Complement C1q subcomponent subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QAP02745 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QAP02745 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QAP02745 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QAP02745 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QAP02745 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QAP02745 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QAP02745 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QAP02745 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QAP02745 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QAP02745 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QAP02745 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QAP02745 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QAP02745 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QAP02745 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QAP02745 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QAP02745 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QAP02745 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QAP02745 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QAP02745 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QAP02745 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C1QAP02745 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QAP02745 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QAP02745 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QAP02745 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QAP02745 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QAP02745 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QAP02745 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QAP02745 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QAP02745 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QAP02745 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QAP02745 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QAP02745 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QAP02745 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QAP02745 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QAP02745 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QAP02745 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QAP02745 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QAP02745 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1QAP02745 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QAP02745 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QAP02745 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QAP02745 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QAP02745 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QAP02745 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QAP02745 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QAP02745 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QAP02745 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QAP02745 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QAP02745 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QAP02745 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QAP02745 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QAP02745 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QAP02745 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QAP02745 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QAP02745 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QAP02745 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QAP02745 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QAP02745 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QAP02745 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QAP02745 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QAP02745 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QAP02745 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QAP02745 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QAP02745 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QAP02745 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1QAP02745 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1QAP02745 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1QAP02745 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1QAP02745 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1QAP02745 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1QAP02745 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C1QAP02745 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1QAP02745 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1QAP02745 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QAP02745 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QAP02745 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QAP02745 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QAP02745 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QAP02745 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QAP02745 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QAP02745 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QAP02745 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QAP02745 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QAP02745 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QAP02745 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QAP02745 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QAP02745 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QAP02745 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QAP02745 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QAP02745 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QAP02745 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QAP02745 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QAP02745 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QAP02745 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QAP02745 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QAP02745 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QAP02745 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QAP02745 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QAP02745 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QAP02745 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms